Возможно не только в принципе. Просто сохрани профайлы лисы и птицы, потом положи их в своем домашнем каталоге в Linux. Профайл лисы в ~/.mozilla/firefox, профайл птицы ~/.thunderbird. Как их задействовать - 100 раз обсуждалось наэтом форуме, поиск рулит. Можно использовать один и тот же профайл и для вин и для лин версии приложения, только он должен лежать на фат32 разделе и у юзера линакс должны быть права на запись. Сам также недавно совершил переход на Linux, но полный переход - винда отсутствует, поэтому в реализации совместного использования профайлов не могу помочь советом, хотя видел такой вариат работающим.

Проблема, наверное в абсолютных путях, которые прописаные в каких-то *.rdf
Здесь на форуме была тема, там был выложен текст *.bat - файла для исправления путей при переносе профиля. Думаю, под Linux *.sh можно сделать, и получится он красивей.