Поставил Tab Mix Plus
все нормально работает.
Закладки, если открывать их из меню (то есть оттуда, где Переход, Закладки, Инструменты, Справка) то все работает нормально - выбираю закладку открывается новая вкладка. И из боковой панели тоже. Все ОК.

Но у меня часть закладок выведена на панель инструментов. При помощи Toolbar Folder и плагина Multi Bookmarks Toolbars. Вот тут и начинается трабла. закладки открываются только в активном окне и никак иначе. блин

Аналогичная проблема с плагином Add Bookmark Here.
Если добираться через меню - то "Добавить закладку здесь" есть. Если развернуть список с панели инструментов - нету...