из FAQ ссылки на
http://forum.mozilla.ru/doku.php?id=fir … _and_theme
http://forum.mozilla.ru/doku.php?id=gen … installing
я давеча ставила silent(фоновая / background установка) следующим образом на все машины домена.

"\\LANresource\folder\thunderbird setup 2.0.0.4.exe" -ms   
xcopy \\LANresource\folder\default_mail\extensions D:\mail\extensions /e /y 
copy \\LANresource\folder\default_mail\extensions.* D:\mail\ /y   

NB: профили каждого пользователя лежат одинаково на каждом компе в d:\Mail
права на установку - админские. у пользователя ТВ должна быть закрыта.
ставила через Mark Russinovich's PSTools\psexec -u admin_account

как видно из скрипта - всем ставятся одинаковые расширения - и список оных .
насколько я понимаю - настроить расширения можно только в интерактиве под каждого пользователя. притом, каждое расширение имеет свой свособ настройки- он не унифицирован. т.е. может что то и можно настроить через его js или rdf но это частный случай конкретного расширения.