Бесплатная лечебная утилита Dr.Web CureIT!
ftp://ftp.drweb.com/pub/drweb/cureit/cureit.exe

avast! Virus Cleaner - free virus removal tool
http://files.avast.com/files/eng/aswclnr.exe

AVZ
http://z-oleg.com/avz4.zip

Norman Malware Cleaner
http://download.norman.no/public/Norman_Malware_Cleaner.exe

Panda Free commandline scanner
http://research.pandasecurity.com/archive/Free-commandline-scanner.aspx

Sophos Anti-Virus for Win32 Command Line Interface
http://downloads.sophos.com/tools/sav32sfx.exe

Средство удаления вредоносных программ Microsoft Windows - январь 2008
http://download.microsoft.com/download/4/a/a/4aa524c6-239d-47ff-860b-5b397199cbf8/Windows-KB890830-V1.37.exe
Homepage
список чего она чистит и FAQ

McAfee Avert Stinger
брать тут, здесь же список, с чем он ведет борьбу

Kaspersky Lab Tool (Бета версия)
http://devbuilds.kaspersky-labs.com/devbuilds/AVPTool/

a-squared Emergency USB Stick
http://www.emsisoft.com/en/software/stick/

- рецепты создания своих portable антивирусов от их производителей

Kaspersky Anti Virus 7.0х
здесь во вкладке Scan есть утилита Create Rescue Disk, требует наличия под рукой дистрибутива  Windows и PE Builder >= 1.3

Sdat.exe файлы от McAfee
Это официальные "обновления баз и движка", но реально - полноценный консольный сканер. 
распаковывается в папку запуском с ключем -е, после чего в эту папку кладется такой батничек батничек [?] и запускается. 
ссылка

ClamWin - рецепт создания portable версии от производителя
http://www.clamwin.com/content/view/118/89/
Вкратце - сначала инсталлируем антивирус на комп, затем копируем на флешку нужные файлы + нужные библиотеки, наконец настраиваем файл конфигурации - и всё работает, даже антивирусная база обновляется с флешки...