При использовании синхронизации профиля, синхронизируются в том числе и дополнения. Вопрос: дополнения синхронизируются физически и полностью с установленного Firefox, или только ссылки на страницы этих дополнений в addons.mozilla.org?

Если у дополнения есть функция "синхронизации настроек", то настройки тоже восстанавливаются.
Допустим "Unhook - Remove YouTube Recommended & Shorts" имеет такую функцию и выставив галки, после пере установки браузера и синхронизации, он эти галки восстановит.
Тот-же BlockTube или, допустим, Enhancer for YouTube не имеют такой функции и придется настраивать всё заново.
НО! Во многих расширениях-дополнениях есть бэкапы, что спасает от постоянной настройки-перенастройки с нуля тупо импортом.