При запуске браузера, иногда загружаются сами по себе либо в новом окне либо как фрейм - давно закрытые вкладки либо какие то левые сайты, на которых вобще не разу не был, в чём может быть проблема
Проблема в общей незащищенности Вашего компьютера и (как следствие) его заражении вирусами.
Как бы мазила стоит 6.0.1 и постоянно обновляется, антивирус KIS Crystal, Хр лицензия, которая обновляется постоянно, но сама проблема уже давно мучает, ни cureit ни кис при полной проверке никогда ниче не выдавали. Я больше склоняюсь что это все таки мазила, т.к. загрузка давно открытых мной закладок того же рутрекера на определённой теме или еще какого либо сайта - помойму дело не в вирусах и общей защищенности, но бывает что открывает сайты которые как всплывающее окно, которые видимо ранее блочились или кисом или браузером, а щас появляются
Я не знаю такого браузера под названием "мазила". Что же касается Firefox, то сам он по своей воле ничего открывать не будет (если нет специфического вирусного заражения), тем более, как Вы пишете - "левые сайты" (то есть те, на которых Вы ни разу не были, правильно я Вас понимаю?).
Если речь идет о самопроизвольно всплывающих поп-апах, то скрипты, генерирующие такие события, встроены в те страницы, которые Вы и посещаете самостоятельно. Избавиться от этого можно, правильно применяя несколько дополнений, описанных у меня на сайте в разделе "Компоненты" (см. мою подпись). Перечислять их я не буду - прочитаете сами.
К тому же "как бы" 
KIS и cureit не относятся и никогда не относились к числу надежных АВ-средств. Используйте другие.
Может, имеется ввиду, что раньше стоял AdBlock а теперь отключён/удалён/потерялись подписки?
но бывает что открывает сайты которые как всплывающее окно, которые видимо ранее блочились или кисом или браузером, а щас появляются
от рутрекера?? Хм интересно...
Можете СЕЙЧАС проверить антивирусом? - лучше касперским. и лучше полностью.
П.С. подобного ещё у нас не было - наверняка вирус.
Ну как бы он рандомно загружает страницы которые посещались, например контакт мейл.ру и т.п. и не каждый раз, когда запускается браузер. А попапы всякие где не был вообще, возможно с депозита остаётся, там вечно фигня вылазит