В Thunderbird нет возможности удалить цепочку сообщений — удаляются по одному, или необходимо выделить всю цепочку, что очень неудобно, если в ней хотя бы несколько десятков писем. Есть ли нормальная возможность удалить цепочку сообщений сразу?

В Tb 3 Ctrl+Shift+A - выделить всю цепочку, во втором, скорее всего, так же.
Ну и delete её.

Нда, интуитивно понятный интерфейс…