В The Bat!
была удобная система шаблонов, как на новые письма так и на ответ и подписи.....
была такая переменная %CURSOR% и другие......
есть ли что-то подобное в Thunderbird, может в виде расширений или другими словами надо писать?

Прежде чем задавать вопросы можно посмотреть этот форум в разделе посвященном Thunderbird. Только вчера обсуждалась эта тема (даже искать ничего не надо - 3-я тема сверху):
http://forum.mozilla-russia.org/viewtopic.php?id=17456
Все можно сделать