Nikias
Настройки — Основные — Загрузки — Всегда выдавать запрос на сохранение файлов.
При такой настройке, если попытаться второй раз сохранить файл в ту же папку с тем же названием (например, вы оба раза не меняете название файла), операционная система задаст вопрос «"…" уже существует. Вы хотите заменить его?».

Чтобы избавиться от дубликатов файлов на диске в тех случаях, когда вы сохранили их под разными названиями или в разные папки, можно переодически запускать программу поиска дубликатов файлов.

Возможно, что существует какое-нибудь дополнение, которое предотвращало бы сохранение дубликатов в принципе, но вряд ли.