Можете посоветовать какие-нибудь способы чистки диска (физической или посредством компа), или программы для копирования не только файлов, но папок с плохих дисков.
в принципе, линуксовая dd
или какие-нибудь рековереры вроде Filerecoveryangel
С оптики - bad copy pro
AfLaEd
меня часто спасает file slavage 2.0!! класная прога 
меня часто спасает file slavage 2.0!! класная прога
Хм... Гугль молчит как партизан относительно этой проги, а Яндекс:
forum.mozilla.ru / Битые носители
меня часто спасает file slavage 2.0!! класная прога
AfLaEd
Видимо камрад имел в виду File Salvage
Зная английский догадаться нетрудно.