При запуске Thunderbird папки выглядят вот так:

После синхронизации с серверами названия восстанавливаются, но только до следующего перезапуска почтовика.

Это замечено с IMAP- ящиками (по POP3 не юзаю) на разных почтовых серверах.
Началось недавно и сразу на всех п\я (у меня их там шт5). До этого  года 3 проблем не было..

Юзается Thunderbird 17 под убунтой 10,10. Говорить мне о необходимости обновления не стоит. Я в курсе, но пока это не реально.
Интересует вопрос - причины появления и способы лечения. Наверняка я не первый с такой траблой.

У меня на Windows такое бывало, но после перезапуска проблема уходила. Попробуйте хотя бы установить новую версию и проверить, если там не будет такого, значит ничего не поделать, бага есть бага.