Каждый раз при запуске Thunderbird в одном из почтовых ящиков все письма становятся со статусом "не прочитанные". Помечаю их все как прочитаные, перезапускаю программу и тоже самое. В чем проблема?

Недостаточно инфы. См. Руководство по поиску причин возникновения проблем и их устранению

не нашел я там ответа. Все произошло после того как я на сервере перезапустил Cyrus IMAP. Причем некоторые ящики наэтом же сервере ведут себя нормально, а некоторые вот так глючат в Thunderbird.

Версия, протокол, как ведёт себя в других мэйлерах?

version 1.5 Beta 2 (20051006), Windows XP. Протокол IMAP.

как ведёт себя в других мэйлерах?

Поставь версию поновее. Beta 2 нестабильная.

В других мейлерах все ок.
а где взять более новый билд?

jenix
Здесь

Кстати удалил ящик почтовый в программе и создал заново. Все такая же фигня. Даже в других папках тоже ;о)

Установка новой версии не помогла. У меня два ящика на одном и том же сервере. С одним все нормально, с другим каждый раз все письма во всех папках не прочитаны.