Перенес закладки в Скрап и задумался, а назад-то ход есть, т.е. можно будет если чего перетащить назад? Закладки пока не удаляю. Может кто подскажет? Попробовал через Инструменты-Импорт/Экспорт, но это что-то не то.

Автоматом этого сделать пока нельзя.
Когда Скрапбук научится поддерживать настоящие закладки - возможно эту фичу добавят.
Но я бы особо не надеялся - он и так до сих пор кое-как работает