Вобщем проблемы следущие.
1. Есть ли в этой версии возможность работы через pop3 сервер?
2. Некоторые сообщения имеют тему в таком виде  ????????????????, некоторые =?windows-1251 и т.д.

Это как то решается?

1. POP3 можно указать как при создании учётной записи, так и в настройках Инструменты => Параметры учётной записи... => ваша почта@mail.ru => Парметры сервера.
2. Интструменты => Настройки => Отображение => Вкладка "форматирование" => Дополнительно => раздел кодировки (внизу).
Или Вид => Кодировка, если неправильная кодировка в письме.;)

поиск, FAQ, wiki