Имеем в наличии АСП линух 10 и Thunderbird 1.0.2 с их же обновления. Настраиваем антиспам фильтр. Точнее просто включаем и указываем "переносить спам в папку спам". И ничего. Письма остаются в папке "Входящие" и преносятся только если "Применить спам фильтр к папке".
Как это победить?

Фильтр должен обучатся, да и это тоже не всегда помогает, иногда письма уходят в папку Спам, универсального фильтра не существует, для локальных папок тоже настрой так, как и для других учётных.