Ранее я успешно переносил Лису со всеми расширениями с одного МЕ на другой установкой Лисы и копированием папок
\Program Files\Mozilla Firefox\
и
\WINDOWS\Application Data\

Оказалось, что на Висте папки с расположением \WINDOWS\Application Data\ просто нет. Всё равно скопировал, но ничего не получилось. Лиса стоит стандартная без того миллиона настроек, что я сделал.

Куда скопировать содержимое папки Application Data, чтобы настройки и расширения вернулись и можно ли вообще решить эту проблему таким способом? Если нельзя, что делать, как скопировать Лису со всеми настройками со старого компа?

В Висте профиль расположен в другом месте:
C:\Users\<Windows login/user name>\AppData\Roaming\Mozilla\Firefox\Profiles\<Profile name>\

А мой старый ФайрФокс об этом будет знать?

Будет

Даже не спрашиваю, как она об этом узнала, потому что я счастлив - моя лисонька полностью работает со всеми расширениями.
И у меня очень важный для меня, философский вопрос, вижу, что появилась вторая и даже третья лиса, есть ли какая-то польза или какой-то вред от перехода с моей любимицы?

Я бы посоветовал перейти на Firefox 2, т. к. предыдущие версии больше не поддерживаются. Firefox 3 выйдет где-нибудь в ноябре, пока есть только альфа версии.

А MozBackup под Вистой не работает?