Извините, может было, но нет времени внимательно искать.
Суть: Thunderbird 2.0.0.0 (20070326) rus. Win XP SP2 rus с апдейтами. 2 GB ОЗУ и 4 винта -- ресурсов достаточно. Каспер 6 и Outpost (файрволл был выключен).
Ранее исчезновений писем не было.
В локальных папках Thunderbird создана папка WORK, внутри ее -- подпапки по заказчикам. Зарегистрировано несколько аккаунтов, работал в данный момент с аккаунтом на gmail.com.
В папке "Входящие" выделяю десяток писем (некоторые с аттачментами от десятков килобайт до 3 мегабайт на письмо) и переношу в только что созданную папку "Локальные папки/WORK/новый заказчик". Из десяти писем в локальной папке появляются 2 письма, потом что-то происходит тихо и появляется вместо третьего письма пустая строчка -- ни названия, ни темы, ни отправителя -- только дата 01.01.1970 03:00. При попытке открыть это псевдо-письмо, сначала открылось девственно-чистое окно (только полоска с кнопками вверху), а когда попробовал открыть второй раз для скриншота, после двойного клика псевдописьмо просто исчезло из списка.
Итак: в локальной папке 8 писем нет, из входящих они исчезли. Перезапуск Thunderbird ничего не изменил. Ну и что? Ладно, у меня стоит хранение на gmail -- сейчас через браузер пойду доставать дубли. А если бы это был другой ящик? Переписка вообще-то рабочая.
Сообщений об ошибках не было, все произошло тихо, только минутку песочные часики покрутились.

С уважением, Дмитриев Сергей.

=> Thunderbird

Попробуйте поставить последнюю сборку 2.0.0.4pre

Спасибо, скачиваю. Испытаем.

С уважением, Сергей.

Был похожий случай. Пересоздал индексный файл проблемной почтовой папки (тот, имя которого состоит из названия почтовой папки и расширения .msf) и все "пропавшие" сообщения появились. Чтобы пересоздать индекс, закрыл Thunderbird, нашел индексный файл в профиле и удалил его, запустил Thunderbird.