Ты переустанавливал систему с быстрым форматированием раздела или с полным? Если с быстрым, то мизерные шансы восстановить закладки ещё есть - правда придётся скачать что-то вроде Акронисовской утилиты для восстановления файлов (причём в виде загрузочного диска, на диск С ничего не качай), она просканирует не занятую область и возможно найдёт там ошмётки от старой файловой системы. Сомнительно это, но мало лои?
Если полное форматирование делал, то такое возьмутся восстанавливать только за серьёзные деньги в лаборатории и если там нет ни чего критически важного, то игра не стоит свеч.

dredei пишет

с папки Program Files???

Если так, то теперь вся надежда на программы восстановления файлов. Файл с закладками в папке профиля, а она, в свою очередь, находится в C:\Documents and Settings\имя пользователя\Application Data\Mozilla\Profiles\default\

Andrei-vd пишет

скопировал все файлы Мозилы

Из какой папки копировал?