У нас точно такая же проблема. Проявляется именно в третьей версии Мазиллы. Есть несколько imap ящиков, к каждому из которых подключено несколько человек. Так вот когда один человек ставит метку  - у других может сразу отразится, а может и нет. Причём статус прочитанные или не прочитанные меняются сразу.  Во второй версии таких глюков не было. Смог кто-нибудь решить данную проблему?