Приветствую!

Давно уже тянется эта волынка, даже не помню с какой версии почтовика, но: письма не удаляются ни по delit, ни по пункту контекстного меню "удалить сообщение". На нескольких машинах это происходит. Письма удаляются лишь по "Shift+del", то есть если окончательно.
Папки сжимал. Версия самая актуальная (но на некоторых машинах есть и более старые).